Funkcijos:
- Koordinuoja ikimokyklinio, priešmokyklinio, bendrojo ugdymo klausimus.
- Koordinuoja švietimo kokybės ir regioninės politikos klausimus ikimokyklinio, priešmokyklinio ir bendrojo ugdymo srityse.
- Koordinuoja švietimo pagalbos klausimus.
- Koordinuoja smurto, patyčių ir kitų sričių prevencijos mokyklose, vaiko minimalios ir vidutinės priežiūros klausimus.
- Koordinuoja valstybinės švietimo teikėjų priežiūros klausimus ikimokyklinio, priešmokyklinio, bendrojo ugdymo, švietimo pagalbos srityse.
- Koordinuoja neformalųjį ikimokyklinį, priešmokyklinį ir neformalųjį vaikų švietimą ir jo kokybę.
- Kontroliuoja ir koordinuoja Nacionalinės švietimo agentūros (stebėsenos ir vertinimo, ikimokyklinio, priešmokyklinio, bendrojo ugdymo turinio, švietimo pagalbos srityse), Lietuvos mokinių neformaliojo švietimo centro, Lietuvos įtraukties švietime centro veiklas.
- Kontroliuoja ir koordinuoja Lietuvos aklųjų ir silpnaregių ugdymo centro, Lietuvos kurčiųjų ir neprigirdinčiųjų ugdymo centro ir Diemedžio ugdymo centro (mokyklų ir mokinių konsultavimo, kvalifikacijos tobulinimo, specialiųjų ugdymosi poreikių vertinimo srityse) veiklas.
- Organizuoja ir kontroliuoja, kaip vykdomi Lietuvos Respublikos Ministro Pirmininko, Lietuvos Respublikos Vyriausybės (toliau Vyriausybė) ir švietimo, mokslo ir sporto ministro pavedimai.
- Ministro pavedimu koordinuoja tarptautinius ir regioninius ryšius pagal nustatytas veiklos sritis.
- Koordinuoja švietimo kokybės ir regioninės politikos klausimus ikimokyklinio, priešmokyklinio ir bendrojo ugdymo srityse.
- Koordinuoja švietimo įstaigų vadovų ir kitų pedagoginių darbuotojų (išskyrus mokslininkus ir dėstytojus) kvalifikacijos tobulinimo, veiklos vertinimo ir susijusius klausimu.
- Kontroliuoja ir koordinuoja Europos Sąjungos struktūrinės paramos programas, priemones pagal nustatytas veiklos sritis.
- Organizuoja ir kontroliuoja teisės aktų projektų rengimą ir derinimą su suinteresuotomis institucijomis.
- Vykdo kitus nenuolatinio pobūdžio su įstaigos veikla susijusius pavedimus.